Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 SUPT4H1-207ENST00000581540 668 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 THADA-204ENST00000403856 6939 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 AC107398.3-201ENST00000562284 7000 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 VN1R3-201ENST00000418822 919 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.3 ms