Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 ZNF385D-AS1-201ENST00000412369 705 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 AL662797.2-201ENST00000607333 527 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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CCDC96Q2M329 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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CCDC96Q2M329 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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CCDC96Q2M329 LINC00483-203ENST00000450727 686 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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CCDC96Q2M329 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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CCDC96Q2M329 DAAM1-208ENST00000556135 582 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 LINC01028-201ENST00000586373 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
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