Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR6

KRTAP3-3, Keratin-associated protein 3-3, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP3-3Q9BYR6 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 KCNE1-209ENST00000621601 3148 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 NBPF26-203ENST00000611702 1831 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 DNAJC2-204ENST00000412522 3033 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ZNF141-201ENST00000240499 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 GLT1D1-205ENST00000537468 1714 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 LRRD1-205ENST00000458448 2830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AL512488.1-201ENST00000433544 1671 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 SEPT10-205ENST00000415095 1605 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ERBB2-218ENST00000584450 3730 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 CACNA1F-202ENST00000376251 5813 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 DNALI1-201ENST00000296218 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 PDE4C-210ENST00000597297 1559 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 SLC24A3-202ENST00000613834 3694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 RHBDL3-201ENST00000269051 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 MLC1-202ENST00000395876 3601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 OSBPL7-201ENST00000007414 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 DLAT-202ENST00000393051 3517 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 RUNX1T1-215ENST00000518844 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 HGSNAT-201ENST00000379644 5236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AL583836.1-201ENST00000464755 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 MELK-209ENST00000541717 2363 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ZNF611-206ENST00000595798 2395 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 MPP4-201ENST00000315506 2330 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 PLEKHB2-208ENST00000439822 4177 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 MAPK10-316ENST00000641430 2285 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 KIFAP3-206ENST00000538366 3159 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 KCNAB1-201ENST00000302490 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 SALL2-207ENST00000614342 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 BOLL-202ENST00000321801 3135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 NUTM2A-201ENST00000381689 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 CLU-201ENST00000316403 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 LAX1-203ENST00000442561 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ADGRG1-266ENST00000568908 3852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 MIR4435-2HG-201ENST00000308604 552 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 COX4I2-201ENST00000376075 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AL391987.4-201ENST00000377547 439 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AL158151.2-201ENST00000434250 241 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AC010163.1-201ENST00000434440 520 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 BX842568.1-201ENST00000435382 551 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AL359692.1-201ENST00000451069 265 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AL096701.3-202ENST00000483736 615 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AC092336.1-201ENST00000510562 415 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AC009927.2-201ENST00000520812 481 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AP000439.2-201ENST00000542064 726 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AC025031.2-201ENST00000550319 627 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AL117190.2-201ENST00000554041 289 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 MIR22HG-206ENST00000573127 899 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AC004702.1-201ENST00000580225 195 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AC005703.4-201ENST00000580422 538 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AC016590.1-203ENST00000590889 547 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AL354740.1-202ENST00000612837 290 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 GALNTL6-207ENST00000616459 1254 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 SYN3-213ENST00000619146 561 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 POMGNT1-202ENST00000371992 2934 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 WWP2-202ENST00000359154 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 CARD14-209ENST00000573882 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ATG4C-203ENST00000371120 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 PPARG-209ENST00000397026 2029 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 PAMR1-206ENST00000615849 2801 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ERCC5-201ENST00000355739 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 NPAP1P6-201ENST00000440671 3484 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 IL36RN-201ENST00000346807 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 FAN1-203ENST00000561607 2690 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms