Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SPOCK3Q9BQ16 AP000577.1-201ENST00000624366 878 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SPOCK3Q9BQ16 AC093909.6-201ENST00000624757 775 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SPOCK3Q9BQ16 PPP3R2-201ENST00000374806 3387 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SPOCK3Q9BQ16 LIG4-202ENST00000405925 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SPOCK3Q9BQ16 TNR-202ENST00000367674 12949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SPOCK3Q9BQ16 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SPOCK3Q9BQ16 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SPOCK3Q9BQ16 VPS45-201ENST00000369128 2224 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SPOCK3Q9BQ16 SLC17A3-203ENST00000361703 1543 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SPOCK3Q9BQ16 NEK10-201ENST00000295720 2871 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SPOCK3Q9BQ16 RTN4-206ENST00000394611 4161 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SPOCK3Q9BQ16 GPM6A-202ENST00000393658 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SPOCK3Q9BQ16 UVRAG-208ENST00000532130 1831 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SPOCK3Q9BQ16 PCDH15-224ENST00000612394 5765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SPOCK3Q9BQ16 CUBNP1-201ENST00000412710 1790 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SPOCK3Q9BQ16 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SPOCK3Q9BQ16 ARMCX5-206ENST00000604957 4640 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SPOCK3Q9BQ16 TRIM48-201ENST00000417545 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SPOCK3Q9BQ16 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SPOCK3Q9BQ16 MAPK10-345ENST00000641724 2980 ntAPPRIS P2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SPOCK3Q9BQ16 MARK3-203ENST00000335102 2331 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SPOCK3Q9BQ16 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SPOCK3Q9BQ16 POLR2D-201ENST00000272645 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SPOCK3Q9BQ16 ERG-205ENST00000398910 4954 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SPOCK3Q9BQ16 DCLRE1C-207ENST00000378255 2807 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SPOCK3Q9BQ16 TDRD3-202ENST00000377881 2532 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SPOCK3Q9BQ16 CPNE4-208ENST00000511604 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SPOCK3Q9BQ16 SPRYD4-201ENST00000338146 10779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SPOCK3Q9BQ16 AL109810.2-201ENST00000425559 1348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SPOCK3Q9BQ16 STMND1-203ENST00000536551 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SPOCK3Q9BQ16 DCAF1-203ENST00000504652 5951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SPOCK3Q9BQ16 CAST-236ENST00000511782 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SPOCK3Q9BQ16 TMTC1-201ENST00000256062 8805 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SPOCK3Q9BQ16 CEP290-207ENST00000552810 7948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
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SPOCK3Q9BQ16 OR1F1-201ENST00000304646 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
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SPOCK3Q9BQ16 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SPOCK3Q9BQ16 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SPOCK3Q9BQ16 RPE-204ENST00000411934 792 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SPOCK3Q9BQ16 PCBP1-AS1-212ENST00000418308 863 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
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SPOCK3Q9BQ16 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
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SPOCK3Q9BQ16 LINC01347-202ENST00000627498 3841 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
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SPOCK3Q9BQ16 CDKL5-209ENST00000635828 3823 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SPOCK3Q9BQ16 GOSR2-222ENST00000639031 885 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SPOCK3Q9BQ16 CCR9-201ENST00000355983 2653 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SPOCK3Q9BQ16 DYDC2-201ENST00000256039 1842 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SPOCK3Q9BQ16 RAB2B-201ENST00000397762 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SPOCK3Q9BQ16 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SPOCK3Q9BQ16 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
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