Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 TMEM87A-203ENST00000448392 3049 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 KDM4A-AS1-205ENST00000453015 647 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 SUPT20H-205ENST00000464744 2625 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 SYNE1-217ENST00000466159 2610 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 CLASP2-213ENST00000480013 5972 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 ALG13-214ENST00000482742 620 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 RPL7AP26-201ENST00000488538 813 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC139272.1-201ENST00000505516 640 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC092336.1-201ENST00000510562 415 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC087521.3-201ENST00000528226 553 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 CTNND1-221ENST00000529873 5931 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 CTNND1-227ENST00000530748 5925 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 LINC02443-201ENST00000536518 585 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 APEX1-214ENST00000557054 888 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 RPL12P38-202ENST00000588627 2319 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 SIDT2-219ENST00000620360 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC005383.1-201ENST00000622689 534 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 HBG1-202ENST00000632727 369 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 PRPS1L1-202ENST00000638645 957 ntAPPRIS P2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 SMG7-202ENST00000367537 5970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 CALML4-203ENST00000395465 4155 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 MYO5C-201ENST00000261839 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 MTRR-201ENST00000264668 3274 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 KRIT1-203ENST00000394505 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AL359924.1-201ENST00000450451 3127 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 LINC00927-203ENST00000558913 2878 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 SNRPB2-201ENST00000246071 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 CEP95-201ENST00000553412 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC007126.1-201ENST00000508202 4781 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 ABLIM1-205ENST00000369266 2230 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 PDE1A-203ENST00000409365 2034 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 SERPINB2-201ENST00000299502 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 CALCOCO2-201ENST00000258947 3682 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 POGZ-201ENST00000271715 6626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 CPM-201ENST00000338356 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 CU633967.1-204ENST00000624627 1604 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 CPB2-AS1-204ENST00000606991 3218 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 PYHIN1-204ENST00000392252 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 NACAP1-201ENST00000419462 1555 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 CPEB4-209ENST00000522336 1551 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 PLXDC2-203ENST00000377252 12468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 ANKRD27-201ENST00000306065 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 SUPT7L-201ENST00000337768 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 PDLIM5-221ENST00000542407 2979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 PDXDC1-201ENST00000325823 1113 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 RNA5SP141-201ENST00000364543 120 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 RNA5SP442-201ENST00000365050 107 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 TRAV22-201ENST00000390450 464 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 RPS6KA2-IT1-201ENST00000416770 579 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC007384.1-202ENST00000417026 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AL445430.2-201ENST00000423149 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 FBP2P1-202ENST00000424473 530 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 OR5P4P-201ENST00000424698 917 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 Z97634.1-203ENST00000435229 471 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 PSMD8P1-201ENST00000436275 769 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AL022721.1-201ENST00000436521 505 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 RPL36AP55-201ENST00000454114 305 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 LINC00652-202ENST00000454749 963 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 RPL5P15-201ENST00000475870 897 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 NR1I3-233ENST00000515452 1093 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC044836.1-201ENST00000519514 274 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC023080.1-201ENST00000551663 931 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 HNRNPC-226ENST00000556628 1156 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC127029.1-201ENST00000560822 237 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AL008726.1-201ENST00000607703 569 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AL139254.2-202ENST00000641937 1156 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
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