Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 LINC01676-209ENST00000623043 896 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 LINC01013-205ENST00000458028 1345 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 MS4A3-201ENST00000278865 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 AL121823.1-201ENST00000418369 741 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 BMP6P1-201ENST00000431230 679 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 RABGAP1L-216ENST00000486220 772 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 AL359232.1-202ENST00000556874 1206 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
GOLGA8SH3BPF8 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.3 ms