Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 RNU2-45P-201ENST00000516068 187 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 RPL10P18-201ENST00000519384 309 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 AL135934.1-201ENST00000527684 537 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 RGS5-220ENST00000528689 566 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 DNM1P31-201ENST00000564149 696 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 CMC2-213ENST00000565914 528 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 AC126323.5-201ENST00000569913 592 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 AC087292.1-201ENST00000573371 512 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 LINC01892-201ENST00000579141 507 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 AC015908.3-202ENST00000579367 457 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 CT45A10-201ENST00000611668 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 AP000842.4-201ENST00000638781 748 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 AL021396.1-202ENST00000457707 1929 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 POF1B-202ENST00000373145 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 RNF219-201ENST00000282003 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 SORBS1-207ENST00000371239 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 ZNF160-208ENST00000599056 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 RBBP4-206ENST00000458695 1674 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 CYB5B-201ENST00000307892 4286 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 LINC01990-201ENST00000609293 1487 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 IFT80-225ENST00000496589 3073 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 TRAV6-201ENST00000390428 404 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 PPP1R17-202ENST00000409146 569 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 IFNA12P-201ENST00000413147 571 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 VNN3-205ENST00000417437 1117 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 AC064875.1-203ENST00000422996 582 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 OR5P4P-201ENST00000424698 917 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 MED15P9-201ENST00000424716 533 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 GAPDHP32-201ENST00000433816 998 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 UBQLN1P1-207ENST00000441056 1169 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 RPS29P5-201ENST00000452777 171 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 MIR4500HG-204ENST00000453832 827 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 LINC02530-201ENST00000457945 894 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 AC106774.2-201ENST00000510266 406 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 AC017007.5-201ENST00000511590 874 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 AC008676.1-202ENST00000520658 545 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 CA1-219ENST00000523022 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 AC018523.1-201ENST00000534211 512 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PMS2P11Q13670 AC023595.1-201ENST00000536216 564 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms