Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 MT1A-201ENST00000290705 396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 RNA5SP152-201ENST00000365184 110 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 S100A7-202ENST00000368723 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AL079341.1-201ENST00000404701 1207 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC019130.1-201ENST00000413841 391 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 PPIAP23-201ENST00000420099 497 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AL138479.1-201ENST00000426913 484 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 ETF1P1-206ENST00000427296 984 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AL592114.2-201ENST00000440142 532 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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IFT88Q13099 PVT1-214ENST00000522875 922 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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IFT88Q13099 AC044839.3-201ENST00000532068 860 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 SETP17-201ENST00000534163 817 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 CNIH1-205ENST00000556113 523 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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IFT88Q13099 CCL2-202ENST00000580907 736 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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IFT88Q13099 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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IFT88Q13099 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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IFT88Q13099 AC114546.4-201ENST00000624413 369 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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IFT88Q13099 AC092701.1-201ENST00000623627 1551 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 PPP1R11-206ENST00000376773 1640 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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