Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 INPP5B-206ENST00000458109 3979 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 IFIH1-201ENST00000263642 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 SORBS2-231ENST00000449407 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 ODF2-201ENST00000351030 3899 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 ZWILCH-214ENST00000613446 3181 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 MORC2-202ENST00000397641 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 COL9A1-202ENST00000357250 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 FAM153A-223ENST00000614127 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 VWFP1-201ENST00000457911 2907 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 MYO5B-201ENST00000285039 9505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 CTCFL-209ENST00000433949 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 C2CD2-201ENST00000329623 5844 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 NECAP1-210ENST00000638237 2517 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 LRRC52-201ENST00000294818 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 CMTR2-202ENST00000434935 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 SSRP1-201ENST00000278412 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 FLJ22447-201ENST00000229465 1655 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 ZFP37-202ENST00000553380 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 AC124798.1-201ENST00000568280 2883 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 RAD51D-202ENST00000345365 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 SH3BGRL2-201ENST00000369838 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 MIER1-203ENST00000357692 4978 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 AL080312.1-201ENST00000256654 824 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 NME9-202ENST00000333911 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 FCAMR-203ENST00000400962 1898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 AC104134.1-201ENST00000413234 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 USP17L10-201ENST00000417945 1593 ntAPPRIS P2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 GNL3-202ENST00000418458 2040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 SMYD1-201ENST00000419482 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 COX7A1-202ENST00000437291 407 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 TUBBP2-201ENST00000454403 411 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 AL049747.1-201ENST00000472240 852 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 RAB5CP2-201ENST00000505368 637 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 GATA6-AS1-201ENST00000579431 481 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 AL365205.3-201ENST00000593368 169 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 AL139351.1-201ENST00000622092 320 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 MRPS35-201ENST00000081029 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 MUC21-202ENST00000486149 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 TECTA-202ENST00000392793 7426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 AC008132.1-201ENST00000419447 2068 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 NR2F2-AS1-201ENST00000502125 1930 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 GALNT11-208ENST00000434507 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 PDYN-201ENST00000217305 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 FO393415.1-201ENST00000314481 2255 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 PRCP-202ENST00000393399 2120 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 FRG2-202ENST00000504750 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 LAMA4-219ENST00000522006 6438 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 ATP1A3-201ENST00000302102 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 SLC43A3-202ENST00000395123 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 LINC01358-211ENST00000635571 1687 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 MOG-218ENST00000376894 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 KRIT1-202ENST00000394503 2827 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 TCF7-203ENST00000395023 2815 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 ALDH1L1-201ENST00000273450 3179 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 MAN2A2-201ENST00000360468 6268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 TCN2-203ENST00000407817 1870 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 MYO1C-204ENST00000545534 3676 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 TTC30A-201ENST00000355689 5975 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 TBC1D8B-201ENST00000276175 3538 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 SH3TC2-211ENST00000512049 4002 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 TMEM130-205ENST00000450876 3891 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 KIAA1683-207ENST00000600359 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 CPEB3-202ENST00000412050 7664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 GEMIN4-201ENST00000319004 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 PABPC1-224ENST00000610907 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 ST6GALNAC1-201ENST00000156626 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 ITGA7-206ENST00000553804 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 KARS-202ENST00000319410 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 TIAM2-212ENST00000529824 5262 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 AC106865.1-202ENST00000507055 2292 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 GAS7-204ENST00000437099 8003 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 PPIE-201ENST00000324379 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 Metazoa_SRP.2-201ENST00000359385 269 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 AL831784.1-201ENST00000427302 373 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 RPL15P1-201ENST00000439981 600 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 LINC01006-205ENST00000440711 336 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 AC097535.2-201ENST00000507715 142 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 AC109635.2-202ENST00000529219 500 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 AP003119.1-201ENST00000533437 538 ntTSL 4 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 GPRASP2-204ENST00000535209 3847 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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