Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 DNMBP-203ENST00000543621 4178 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 PRUNE1-202ENST00000368934 2214 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 TOM1L1-220ENST00000575333 1849 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
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PTPRMP28827 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 PFDN1-207ENST00000524074 395 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 PRLR-208ENST00000509140 1610 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 HTR1D-201ENST00000374619 2835 ntAPPRIS P1 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 MAGT1-204ENST00000610432 4019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 B3GALT1-201ENST00000392690 5094 ntAPPRIS P1 BASIC8.91□□□□□ -0.98
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PTPRMP28827 VPS13A-203ENST00000360280 15320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 ZHX3-218ENST00000560364 4283 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
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PTPRMP28827 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
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PTPRMP28827 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
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PTPRMP28827 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
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