Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AC078864.1-201ENST00000547538 512 ntTSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AL049829.2-201ENST00000554010 285 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
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PTPRCP08575 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 NEK11-201ENST00000356918 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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PTPRCP08575 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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PTPRCP08575 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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PTPRCP08575 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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PTPRCP08575 TCEAL8-202ENST00000372685 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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PTPRCP08575 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 ADTRP-201ENST00000229583 891 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
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