Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 TCF4-225ENST00000564999 3590 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC7.92□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC7.92□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AC011379.1-201ENST00000508713 3025 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 NAT1-206ENST00000518029 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 ZNF385B-201ENST00000336917 2610 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 MYO1B-203ENST00000392316 4764 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 ZC3H13-201ENST00000242848 8018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 TCL6-203ENST00000459662 3307 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 RPS14P4-201ENST00000415880 418 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AC026992.2-201ENST00000570122 766 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 FCGR1B-210ENST00000623603 1581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms