Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AL121823.1-201ENST00000418369 741 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AC048341.3-201ENST00000619323 491 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AL359885.1-201ENST00000415786 903 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AL139231.1-201ENST00000431001 312 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 NATP-201ENST00000523491 878 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms