Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 URM1-202ENST00000372850 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 DIP2A-202ENST00000417564 6967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 PDCL-201ENST00000259467 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 BDNF-201ENST00000314915 4340 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 ERVV-1-201ENST00000602168 2202 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 PDE11A-203ENST00000409504 2102 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 STAG1-210ENST00000629124 4322 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 CLK1-215ENST00000621181 1843 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 DEPDC5-205ENST00000400248 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 POLR1A-203ENST00000409681 6454 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 TSHZ1-201ENST00000322038 4992 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 EXOSC10-201ENST00000304457 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 TAF9B-201ENST00000341864 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 SNX29-205ENST00000566228 8171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AGAP1-207ENST00000428334 10090 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 FGF1-204ENST00000378046 2582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 TYW1B-202ENST00000612372 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 DAB2-217ENST00000545653 4537 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 ZNF592-203ENST00000560079 8131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 POLR2D-201ENST00000272645 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 ANKRD13C-202ENST00000370944 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 GRIA1-201ENST00000285900 5708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 SERPINB2-205ENST00000457692 2155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 KDM4D-203ENST00000610872 2191 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 PCSK2-201ENST00000262545 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AL590617.1-201ENST00000405630 748 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 SMIM12-201ENST00000417239 684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AL671883.1-201ENST00000421191 306 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 LINC01384-201ENST00000422494 659 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 LINC01006-203ENST00000425712 661 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC091132.2-201ENST00000433601 769 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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MKRN4PQ13434 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
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MKRN4PQ13434 AC107220.1-201ENST00000514347 1037 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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MKRN4PQ13434 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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MKRN4PQ13434 AC012594.1-214ENST00000630496 858 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 LINC01835-203ENST00000639800 567 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
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MKRN4PQ13434 AC240565.2-201ENST00000623180 2096 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 TULP4-201ENST00000367094 5170 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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MKRN4PQ13434 ANKRD1-201ENST00000371697 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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MKRN4PQ13434 ZFYVE26-201ENST00000347230 9675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 LINC02254-201ENST00000558621 1726 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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MKRN4PQ13434 THADA-202ENST00000402360 2974 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 ZFYVE26-209ENST00000557306 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 GLE1-201ENST00000309971 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 TNS1-209ENST00000446688 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 CENPC-201ENST00000273853 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 DDX3X-217ENST00000629496 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 NLRP10-201ENST00000328600 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 RPL11-201ENST00000374550 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 CBWD1-207ENST00000382447 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 CHCHD2P5-201ENST00000421414 400 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
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