Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 AC009656.1-201ENST00000531966 478 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 AC108449.2-201ENST00000560865 552 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 BUB1P1-201ENST00000603541 607 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 STAMBPL1-201ENST00000371922 1899 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 PPP2R3A-202ENST00000334546 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 HEPACAM2-201ENST00000341723 2122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 APOL4-212ENST00000616056 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 IMPG1-201ENST00000369950 3558 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 PROM1-219ENST00000539194 3884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 TCF12-205ENST00000537840 1598 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AC008662.1-201ENST00000521805 674 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 HTR2A-203ENST00000543956 4689 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 RBBP4-202ENST00000373493 7943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 CUBNP3-201ENST00000457461 1784 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
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