Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 ELOC-205ENST00000520210 1451 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 NPIPB15-201ENST00000429990 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 SPATA45-201ENST00000332912 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 OR10A3-201ENST00000360759 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 ALOX5AP-201ENST00000380490 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP53-201ENST00000391299 120 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 LSM5-202ENST00000409292 538 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP177-201ENST00000410122 107 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP236-201ENST00000410635 284 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AL157932.1-201ENST00000413246 363 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 LINC01431-203ENST00000452395 505 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 PPP1R2P6-201ENST00000478565 588 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL849P-201ENST00000485236 295 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL182P-201ENST00000496499 300 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AL135933.1-201ENST00000498657 802 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC114947.1-201ENST00000511991 432 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 MTCYBP44-201ENST00000514835 823 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP11-201ENST00000517018 287 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC022639.1-202ENST00000524360 581 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 HIGD1AP9-201ENST00000550710 279 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC110603.1-201ENST00000580645 468 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC092032.1-201ENST00000603090 165 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC005277.2-201ENST00000617898 390 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 ATP5J-206ENST00000400099 492 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC084030.1-202ENST00000413385 880 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AL357632.1-201ENST00000426688 643 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC019080.2-201ENST00000453859 394 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 RPSAP48-201ENST00000466509 889 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC021146.11-201ENST00000503319 491 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC122710.2-201ENST00000506093 596 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms