Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 PVT1-214ENST00000522875 922 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AP003548.1-201ENST00000523862 711 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AL662797.2-201ENST00000607333 527 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 CACNB4-225ENST00000636442 4232 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC022613.3-201ENST00000560740 1346 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 MTHFD1P1-201ENST00000413059 2764 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 C1orf162-202ENST00000369718 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AL392046.1-201ENST00000450742 569 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 SNX24-205ENST00000506996 588 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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GRIK2Q13002 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 DTHD1-206ENST00000639862 3819 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 MTCO1P25-201ENST00000414449 1799 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 IGSF6-201ENST00000268389 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 MTND2P12-201ENST00000417560 1252 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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