Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

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Length 1,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 SENP8-201ENST00000340912 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 PTPRT-204ENST00000373190 12559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 JAKMIP2-201ENST00000265272 6001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 SLC23A2-201ENST00000338244 6944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 IL5RA-207ENST00000438560 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 RAPGEF5-202ENST00000401957 6159 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 AC006019.2-201ENST00000451116 3044 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 EPHA1-AS1-202ENST00000429289 5018 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 AC092807.3-203ENST00000467530 2745 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 AC139493.1-201ENST00000604368 397 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 COL6A6-201ENST00000358511 9581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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COL4A5P29400 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 SIPA1L1-203ENST00000537413 4129 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 HSD17B13-202ENST00000328546 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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COL4A5P29400 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 Z99129.3-201ENST00000624363 6430 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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COL4A5P29400 MRRF-202ENST00000344641 9826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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COL4A5P29400 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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COL4A5P29400 ZNF160-208ENST00000599056 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
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COL4A5P29400 PGM5-AS1-202ENST00000420855 572 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 ACSL5-201ENST00000354273 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 BICC1-202ENST00000373886 5475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 VPS13A-203ENST00000360280 15320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 SYTL4-203ENST00000372981 4847 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 ODF2L-202ENST00000317336 4376 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
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