Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

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Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
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CCDC88CQ9P219 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 OR5M2P-202ENST00000641241 4242 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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CCDC88CQ9P219 AL512785.1-201ENST00000447899 517 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
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CCDC88CQ9P219 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 AC073389.3-201ENST00000609434 935 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 SLC30A6-201ENST00000282587 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 ZNF426-201ENST00000253115 7085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 DCAF10-201ENST00000242323 7393 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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CCDC88CQ9P219 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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CCDC88CQ9P219 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 LINC02424-201ENST00000548512 1264 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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CCDC88CQ9P219 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 LINC01687-201ENST00000416327 795 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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