Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AC104698.1-201ENST00000435671 276 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 PPIAP32-201ENST00000449940 472 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AL157896.1-201ENST00000451617 790 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 NDUFB2-215ENST00000482954 544 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 LINC02059-201ENST00000503843 452 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AC092142.1-202ENST00000567021 829 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 IGLJCOR18-201ENST00000584002 424 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AL161420.1-201ENST00000619393 264 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 NUTM2B-AS1-212ENST00000610681 4241 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
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GRIK4Q16099 GAPVD1-207ENST00000394105 5207 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AGL-201ENST00000294724 7446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 GPNMB-201ENST00000258733 2862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 DHX57-203ENST00000457308 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 PNN-201ENST00000216832 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 BZW1-203ENST00000409600 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AC131649.2-201ENST00000624925 4439 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 VEPH1-201ENST00000362010 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 SELENOP-203ENST00000506577 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
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GRIK4Q16099 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
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GRIK4Q16099 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 LINC02447-201ENST00000499242 1500 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 PRLR-212ENST00000513753 1525 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 UBAP2L-203ENST00000361546 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
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