Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 RNU1-55P-201ENST00000365510 158 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 MIR205HG-201ENST00000366437 704 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 S100A7-202ENST00000368723 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 OR10A4-201ENST00000379829 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 PDCL3P5-201ENST00000398028 722 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 FABP6-202ENST00000402432 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 RN7SKP137-201ENST00000411074 307 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 RN7SKP268-201ENST00000411107 316 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AL590095.1-201ENST00000420049 436 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 GAPDHP57-201ENST00000424400 585 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 PAICSP2-201ENST00000429118 1150 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC007179.2-206ENST00000434611 467 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 OR52U1P-201ENST00000439752 923 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AL391361.2-203ENST00000443380 413 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 RPS26P11-201ENST00000463445 348 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 MRPS33-203ENST00000467334 622 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC126615.1-201ENST00000470084 630 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 RPS26P6-201ENST00000475156 348 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 RN7SL518P-201ENST00000491887 280 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC021146.11-201ENST00000503319 491 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC098487.1-203ENST00000512915 546 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 XAGE1B-205ENST00000518075 472 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 GRPEL2-AS1-201ENST00000521295 401 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC008691.1-202ENST00000521472 811 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 PDCL3P1-201ENST00000534575 734 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 MIR4800-201ENST00000537353 80 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 PCED1B-AS1-202ENST00000547600 523 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 ATP5G2-205ENST00000549748 728 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 PCED1B-AS1-207ENST00000551432 522 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AL355102.4-201ENST00000553638 738 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 NQO1-205ENST00000561500 891 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 RN7SL657P-201ENST00000582431 293 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 MIR4428-201ENST00000584884 73 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 ZNF431-206ENST00000599296 586 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC017037.4-201ENST00000624526 826 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC073857.1-201ENST00000625082 1054 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 LEKR1-201ENST00000356539 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 ZFP90-201ENST00000398253 4384 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AADAC-201ENST00000232892 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
USF2Q15853 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 FGD6-205ENST00000549499 3757 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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