Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 LINC01493-202ENST00000533575 581 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 TRIM66-201ENST00000299550 9753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 ZNF559-ZNF177-203ENST00000541595 2435 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 NT5DC1-201ENST00000319550 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 KIAA1024-201ENST00000305428 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 PRICKLE2-205ENST00000638394 9956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 KCNMA1-212ENST00000406533 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 AC025263.1-201ENST00000501387 2538 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 MEGF10-203ENST00000503335 7571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 MED12-202ENST00000374080 6795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 RIF1-205ENST00000444746 7897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 CTNND1-222ENST00000529919 4780 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 RPEL1-201ENST00000441178 2130 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 AL009031.1-202ENST00000632370 886 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 LRBA-204ENST00000507224 8826 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 ZNF549-204ENST00000602149 5505 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 DOCK8-205ENST00000453981 7237 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 STAB2-201ENST00000388887 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 CACNB4-254ENST00000637514 1880 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 GRIN2A-205ENST00000535259 4118 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 SCYL3-202ENST00000367771 6364 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 KAT6B-205ENST00000372725 6944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 PIEZO2-203ENST00000503781 8259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 TNS1-201ENST00000171887 10331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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COL4A5P29400 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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COL4A5P29400 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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COL4A5P29400 CD109-202ENST00000422508 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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COL4A5P29400 PREPL-203ENST00000378520 2308 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 ALG13-224ENST00000610588 4175 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 IGKV1OR10-1-201ENST00000442306 329 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 TNR-202ENST00000367674 12949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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