Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 CPA4-202ENST00000445470 2718 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 IGSF1-206ENST00000370910 4406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 MATN2-208ENST00000520016 3495 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 SERPINB11-205ENST00000544088 1846 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 CTNND1-213ENST00000526357 5994 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 ACSL6-206ENST00000379255 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 CHODL-206ENST00000400135 2136 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 TRIM49-202ENST00000532501 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 EFTUD2-201ENST00000402521 3045 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 FTSJ3-201ENST00000427159 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 CCR9-203ENST00000395963 2512 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 ELP3-202ENST00000380353 3078 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 ELP3-219ENST00000537665 3053 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 RBMS2-204ENST00000550726 1452 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 PLS3-AS1-202ENST00000607680 1763 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 LINC01140-201ENST00000461990 3181 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AL162171.3-201ENST00000617439 3178 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 EYA4-201ENST00000355167 5692 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 PPP1R12A-213ENST00000550107 2925 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 SLC9A6-209ENST00000636347 4867 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 KCNIP2-202ENST00000343195 663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 SSX9-201ENST00000376909 591 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 MAGEB4-201ENST00000378982 2142 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 TRGV3-201ENST00000390346 537 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AL138807.1-201ENST00000400354 459 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 MORF4L1P1-201ENST00000404582 967 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 EEF1A1P34-201ENST00000419888 1267 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 RN7SL815P-201ENST00000470970 290 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AC105910.1-201ENST00000482585 483 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AC092958.1-202ENST00000485006 424 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 PDPN-205ENST00000487038 607 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 OR4F28P-201ENST00000559128 938 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 OR4F8P-201ENST00000589943 937 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 LINC02532-210ENST00000606430 584 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 Metazoa_SRP.189-201ENST00000614219 303 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AC114546.4-201ENST00000624413 369 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AL353747.4-202ENST00000625787 674 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 RASSF3-206ENST00000637125 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 RAP2C-205ENST00000620646 3341 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AC022182.3-201ENST00000529239 2167 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 MTHFD1P1-201ENST00000413059 2764 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 DTNA-209ENST00000556414 1626 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 NCOA4-207ENST00000585132 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 LINC01877-203ENST00000439734 2287 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 RAB13-205ENST00000614713 1353 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 MCM3-207ENST00000616552 3208 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 BNIPL-201ENST00000295294 2336 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 STXBP5L-208ENST00000497029 3036 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AC135731.2-201ENST00000603029 2098 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 NTRK3-221ENST00000629765 2714 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 DCLRE1C-207ENST00000378255 2807 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 NHLRC3-202ENST00000379600 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 CACNB4-231ENST00000636721 1542 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 ETV3-202ENST00000368192 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 THBS3-211ENST00000541990 2928 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 FNDC3B-203ENST00000416957 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 TADA2A-202ENST00000612272 1948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AC136428.3-201ENST00000566387 1990 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 IGLV11-55-201ENST00000390286 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 SLIT1-AS1-201ENST00000424428 689 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 LINC00665-202ENST00000427868 690 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AL512366.1-201ENST00000438919 636 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AL049733.1-201ENST00000440178 603 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 EIPR1-IT1-201ENST00000454977 718 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
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