Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AL445623.1-201ENST00000440888 237 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 DLG5-AS1-201ENST00000449852 487 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AC023886.1-201ENST00000506057 685 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 PTK2-241ENST00000522950 548 ntTSL 4 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AC005261.1-201ENST00000601567 712 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 VDAC1P8-210ENST00000610068 1251 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AC244196.5-201ENST00000617347 406 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
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PTPREP23469 AC026336.5-201ENST00000624455 738 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 NCAM2-202ENST00000400546 8135 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 SYNE1-211ENST00000413186 4860 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 ERVV-1-201ENST00000602168 2202 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 DNAH9-215ENST00000608377 3147 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 DNAJC18-201ENST00000302060 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 BRCA1-208ENST00000468300 3273 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 SPATA31A3-201ENST00000428649 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 SPATA31A5-201ENST00000437823 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 ADH7-205ENST00000482593 1420 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 PHF6-204ENST00000370803 4489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 KIAA1671-206ENST00000637069 6510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AC009264.1-207ENST00000425981 1538 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 FMO9P-202ENST00000488458 1535 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 ZBTB18-202ENST00000622512 3740 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 VIT-208ENST00000497382 2650 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
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PTPREP23469 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 FRMD6-202ENST00000356218 4768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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PTPREP23469 AC127070.5-201ENST00000623177 2104 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AOX1-202ENST00000374700 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PTPREP23469 GNPAT-201ENST00000366647 2643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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PTPREP23469 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PTPREP23469 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
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PTPREP23469 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
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PTPREP23469 AC011726.3-201ENST00000518031 568 ntTSL 4 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
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PTPREP23469 RPL35AP25-201ENST00000584631 330 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
PTPREP23469 BOLA2P1-201ENST00000584794 232 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AC106782.6-201ENST00000611264 512 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AC143336.1-201ENST00000614164 836 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
PTPREP23469 MIR6761-201ENST00000617899 72 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AC025287.2-201ENST00000621911 668 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
PTPREP23469 NLRP3-206ENST00000391828 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PTPREP23469 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
PTPREP23469 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PTPREP23469 CASP12-212ENST00000613512 1451 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PTPREP23469 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
PTPREP23469 TRIM51EP-201ENST00000524374 1516 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
PTPREP23469 LINC02408-201ENST00000400306 1766 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PTPREP23469 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
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