Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC013457.1-201ENST00000556770 1011 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC020891.2-201ENST00000559672 776 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC034105.2-201ENST00000561866 238 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 ARL17A-205ENST00000573185 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 ARL17B-206ENST00000575698 581 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC007861.1-201ENST00000576671 674 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC090699.1-201ENST00000586264 321 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 HIGD1B-205ENST00000591513 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC074135.1-201ENST00000594318 581 ntTSL 4 BASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 BX649601.1-201ENST00000608264 572 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC025162.2-201ENST00000619602 560 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 Metazoa_SRP.20-201ENST00000619896 275 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 LINC01002-216ENST00000632351 572 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 POC1B-AS1-201ENST00000605233 8041 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 PDE7A-202ENST00000396642 2986 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 LINC00347-202ENST00000594461 2371 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 TM4SF1-201ENST00000305366 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AP000866.1-202ENST00000529392 2792 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 DET1-202ENST00000444300 2154 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AL022163.1-201ENST00000430261 1569 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 PYROXD1-201ENST00000240651 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 TCF7L2-209ENST00000369395 1541 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 FGG-204ENST00000405164 1539 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AL391262.1-201ENST00000556558 1992 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 JAM3-202ENST00000441717 3363 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 ARPP21-220ENST00000441454 2880 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 BEST3-205ENST00000488961 2878 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 NBPF15-206ENST00000581897 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 PCBP1-AS1-243ENST00000458698 1893 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AL591543.1-202ENST00000642095 4149 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 KLRD1-203ENST00000350274 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AP002001.1-202ENST00000525797 1754 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 SLC24A1-209ENST00000537259 3983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 TFRC-203ENST00000420415 4814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC002384.1-203ENST00000602761 3049 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 SERPINB12-201ENST00000269491 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AHSP-201ENST00000302312 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 DEFB105A-201ENST00000334773 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 CCNB3-204ENST00000376042 4693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 OLA1P1-201ENST00000396387 1189 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AL772337.2-201ENST00000411992 981 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC093642.1-201ENST00000412193 565 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 YWHAZP5-201ENST00000419975 730 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 OR10G8-201ENST00000431524 1045 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 MRPL22-202ENST00000439747 784 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC099786.1-201ENST00000446238 670 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC013275.1-202ENST00000457436 501 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC113208.1-201ENST00000497944 318 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AP000426.1-201ENST00000518749 361 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AP001782.1-202ENST00000527774 445 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AP006587.5-201ENST00000532033 739 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC078950.1-204ENST00000540635 523 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 MRPL40P1-201ENST00000542687 604 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 STARD6-204ENST00000584040 660 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 MIR3159-201ENST00000584572 74 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC079456.1-201ENST00000624010 480 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 RPSAP68-201ENST00000625020 438 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 MTIF2-201ENST00000263629 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 MYOF-202ENST00000359263 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 UEVLD-205ENST00000396197 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms