Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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SNX13Q9Y5W8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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SNX13Q9Y5W8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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SNX13Q9Y5W8 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
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SNX13Q9Y5W8 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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SNX13Q9Y5W8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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SNX13Q9Y5W8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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SNX13Q9Y5W8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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SNX13Q9Y5W8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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SNX13Q9Y5W8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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SNX13Q9Y5W8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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SNX13Q9Y5W8 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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SNX13Q9Y5W8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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SNX13Q9Y5W8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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SNX13Q9Y5W8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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