Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

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Length 914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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