Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms