Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y282

ERGIC3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC3Q9Y282 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERGIC3Q9Y282 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERGIC3Q9Y282 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERGIC3Q9Y282 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERGIC3Q9Y282 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERGIC3Q9Y282 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERGIC3Q9Y282 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERGIC3Q9Y282 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERGIC3Q9Y282 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERGIC3Q9Y282 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERGIC3Q9Y282 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERGIC3Q9Y282 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERGIC3Q9Y282 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERGIC3Q9Y282 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERGIC3Q9Y282 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERGIC3Q9Y282 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERGIC3Q9Y282 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERGIC3Q9Y282 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERGIC3Q9Y282 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERGIC3Q9Y282 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERGIC3Q9Y282 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERGIC3Q9Y282 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERGIC3Q9Y282 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERGIC3Q9Y282 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERGIC3Q9Y282 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERGIC3Q9Y282 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERGIC3Q9Y282 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERGIC3Q9Y282 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERGIC3Q9Y282 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERGIC3Q9Y282 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERGIC3Q9Y282 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERGIC3Q9Y282 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERGIC3Q9Y282 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERGIC3Q9Y282 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms