Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms