Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
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