Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms