Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms