Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZMYND8Q9ULU4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZMYND8Q9ULU4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZMYND8Q9ULU4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZMYND8Q9ULU4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZMYND8Q9ULU4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZMYND8Q9ULU4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZMYND8Q9ULU4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZMYND8Q9ULU4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZMYND8Q9ULU4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZMYND8Q9ULU4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZMYND8Q9ULU4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZMYND8Q9ULU4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZMYND8Q9ULU4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZMYND8Q9ULU4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZMYND8Q9ULU4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZMYND8Q9ULU4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZMYND8Q9ULU4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZMYND8Q9ULU4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZMYND8Q9ULU4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZMYND8Q9ULU4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZMYND8Q9ULU4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZMYND8Q9ULU4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZMYND8Q9ULU4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZMYND8Q9ULU4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZMYND8Q9ULU4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms