Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
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