Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULP0

NDRG4, Protein NDRG4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG4Q9ULP0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDRG4Q9ULP0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDRG4Q9ULP0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDRG4Q9ULP0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDRG4Q9ULP0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDRG4Q9ULP0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDRG4Q9ULP0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDRG4Q9ULP0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDRG4Q9ULP0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NDRG4Q9ULP0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDRG4Q9ULP0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDRG4Q9ULP0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDRG4Q9ULP0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDRG4Q9ULP0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDRG4Q9ULP0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDRG4Q9ULP0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDRG4Q9ULP0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDRG4Q9ULP0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDRG4Q9ULP0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDRG4Q9ULP0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDRG4Q9ULP0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDRG4Q9ULP0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NDRG4Q9ULP0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NDRG4Q9ULP0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NDRG4Q9ULP0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDRG4Q9ULP0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms