Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC33■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC33■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC33■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms