Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms