Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
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