Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA4

LAMTOR3, Ragulator complex protein LAMTOR3, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR3Q9UHA4 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LAMTOR3Q9UHA4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms