Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms