Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MBD5Q9P267 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms