Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms