Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1D8

PRO2289, Putative uncharacterized protein PRO2289, humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRO2289Q9P1D8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRO2289Q9P1D8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms