Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms