Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms