Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZDHHC3Q9NYG2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZDHHC3Q9NYG2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZDHHC3Q9NYG2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZDHHC3Q9NYG2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZDHHC3Q9NYG2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZDHHC3Q9NYG2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZDHHC3Q9NYG2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZDHHC3Q9NYG2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZDHHC3Q9NYG2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZDHHC3Q9NYG2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZDHHC3Q9NYG2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZDHHC3Q9NYG2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZDHHC3Q9NYG2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZDHHC3Q9NYG2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZDHHC3Q9NYG2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZDHHC3Q9NYG2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms