Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms