Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWT1

PAK1IP1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK1IP1Q9NWT1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms