Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms